มุมมองสองด้านเกี่ยวกับสายพันธุ์พืชดัดแปลงพันธุกรรม

            ข้อได้เปรียบ และเสียเปรียบ ระหว่างสายพันธุ์พืช ที่ได้รับการปรับปรุงตามวิธีการดั้งเดิม (traditional cross breeding) กับสายพันธุ์พืชดัดแปลงพันธุกรรม ที่ได้จากการตัดต่อยีน โดยเทคโนโลยีชีวภาพ และพันธุวิศวกรรม ที่สำคัญคือ พันธุ์พืชที่ได้รับการปรับปรุงตามวิธีการดั้งเดิม มีข้อจำกัดอยู่เฉพาะในพืชชนิดเดียวกันเท่านั้น ถ้าต้องการผสมผสานพันธุกรรม ที่ต้องการ จากพืชต่างชนิดกัน ก็ทำได้ยาก หรือเป็นไปไม่ได้เลย เนื่องจากความแตกต่างกันทางสมบัติด้านชีวภาพ และทางด้านการสืบพันธุ์แบบอาศัยเพศ รวมทั้งความไม่สมพงศ์กัน ทางด้านพันธุกรรม (genetic incompatibility) ระหว่างพืชต่างชนิดกัน แต่ในกรณีของการสร้างสายพันธุ์พืชดัดแปลงพันธุกรรมนั้น สามารถที่จะนำยีน ที่ต้องการจากสิ่งมีชีวิตต่างชนิด ต่างสกุล ต่างวงศ์ หรือแม้กระทั่งต่างอาณาจักรกัน ให้เข้ามาสอดแทรกอยู่ด้วยกัน ในจีโนมพืชเป้าหมายได้ โดยอาศัยกรรมวิธีทางพันธุวิศวกรรม เพื่อทำให้พืชดัดแปลงพันธุกรรมเหล่านั้น มีความต้านทานต่อพวกแมลงศัตรูพืช หรือดื้อต่อยาฆ่าวัชพืช ทำให้ได้ผลผลิตสูงขึ้น อย่างมีประสิทธิภาพ